一、环境政策法规的审计
二、水资源管理体制审计
三、供水情况审计
四、水资源保护情况审计
（一）污水处理厂
（二）污水管网
（三）实地监测
五、饮用水安全审计
六、社会关注点的审计
水资源审计的重点
水既是最重要的经济资源，也是生态环境最活跃的控制性要素，落实最严格水资源管理制度，全面推进水生态文明建设是水资源自然资产审计的重要内容和主要突破口。在水资源审计中应当突破传统的财务收支审计模式，对审计内容进行筛选和整合，既全面跟进又重点突出。
一、环境政策法规的审计
开展水资源审计时，应注重对国家以及省市地方政府的环境法规体系的完善性、有效性以及执行环保政策及其所产生的效益进行科学、合理、独立的评价。具体来说，包括审查环境政策法规的具体规定，审查执行环境政策法规措施的手段和目标是否合理可行等。通过加强环境政策法规相关情况的审计，使当地的环境政策更具规范性、科学性和可操作性，并推出关于规范水资源审计行为的指导文件，增强社会整体的环保意识。
二、水资源管理体制审计
水资源兼具“公益性”和“商品性”双重属性，其开发、利用和治理涉及多个利益主体，水资源管理中存在诸多的问题。地下水开采和江、河、湖、库等水属于水务局管理，居民生活用水属于自来水公司，污水处理厂和污水管网属于住建局管理，污水治理又属于环保局管理。水资源治理属于多头治理，彼此之间没能形成有效的合力。通过水资源审计，可以促进地方政府理顺水资源的管理体制，促进水资源的利用和环保治理。
三、供水情况审计
供水是水资源审计的一项重要内容。它关系到当前和未来供水水质和数量是否有保障，用水比例结构是否符合可持续发展的要求。具体来又可以分为：第一，水资源供需量分析。水资源可持续发展的首要条件是量的保证。审计人员从短期和长期两个角度，根据层层深入的原则，分别分析了水资源总量和自来水的供需情况。第二，供水比例结构
